شبیه سازی دینامیک مولکولی یا Molecular Dynamic simulation (MD) یکی از مهمترین تکنیک های قبل از ورود به مرحله آزمایشگاهی است که کاربرد وسیعی در حوزه داروسازی از قبیل طراحی داروی نوین تا بهینه سازی داورهای گذشته دارا می باشد همینطور در حوزه های مختلف زیست شناسی و ساختار پروتئینی نیز دارای کاربری وسیعی است. کاربرد مهم تکنیک فوق تخمین بسیار دقیق محیط واقعی پروتئین است که به طور تقریبی با درصد بسیار بالایی شرایط آزمایشگاهی پروتئین را در محیط آبی و غشای سلولی و دیگر بخش های احتمالی  سلول را دارا می باشد. اما کارکرد رایج تکنیک MD به جهت بررسی استقامت و پایداری پروتئین از جهت حفظ ساختار سه بعدی خود در محیط آبی است که با ملفه های (دما، فشار و PH و غیره) قابل تنظیم می باشد.

که در تحقیقات مهندسی های پروتئینی بیشترین کاربرد را دارد به صورتی که یک پروتئین موجود در طبیعت را با دستکاری می توان عملکرد آن را تغییر داد. به همین جهت با تکنیک MD قبل از ورود به آزمایشگاه تغییرات صورت گرفته در مقایسه با نمونه کنترل و طبیعی صورت می پذیرد که اصطلاحا فولدینک پروتئین (ساختار سوم پروتئین) آیا دارای تغییرات جدی شده است یا خیر که مطلوب عدم تغییرات جدی در ساختار با وجود تغییرات ایجاد شده است از همین رو میزان اتصال لیگاند و پروتئین را نیز می توان سنجش نمود که به جهت طراحی های دارویی کاربرد وسیعی خواهد داشت.

از نکاتی که باید هنگام سفارش مورد توجه قرار گیرد میزان nano second (ns) که پروتئین قرار است در محیط آبی مورد نظر مورد بررسی قرار گیرد از این رو مدت زمان را با نانو ثانیه قرار می دهیم و حداقل میزان برای مقالات 50 نانو ثانیه می باشد.

توضیحات بیشتر را به صورت تیکت از پشتیبانی سوال کنید.