دپارتمان بیان ژن

تغییر بیان ژن ها یکی از فاکتورهای مهم در تغییرات فنوتیپی است و این مهم توسط تکنیک های حوزه بیان ژنی مورد اندازه گیری است کاربردهای وسیع تشخیصی و درمانی تکنیک های اندازه گیری کننده مولکولی حوزه بیان ژنی به حدی است که در کمتر مقاله معتبری دیده می شود که از آن استفاده نشده باشد و لذا نیاز به یادگیری این حوزه از زیست شناسی روز به روز درحال افزایش است.

به دو صورت مجموعه تکنیک های بیان ژن در یک دوره برای علاقمندان به یادگیری مجموعه تکنیک های بیان ژن و همچنین آموزش جداگانه هر تکنیک برای کسانی که علاقه مند به تکنیک خاصی هستند خدمات در این مرکز ارائه می شود.

کارگاه های آموزشی تکنیک ها به صورت جداگانه

  1. کارگاه آنالیز داده های Microarrays بوسیله نرم افزار (Software)
  2. کارگاه آنالیز داده های Microarrays بوسیله ابزار کدنویسی R-programming
  3. کارگاه آنالیز داده های RNA-Seq بوسیله نرم افزار(Software)
  4. کارگاه آنلیز داده های RNA-Seq بوسیله ابزارهای کدنویسی در لینوکس و R-programming
  5. متاآنالیز داده های Microarrays بوسیله ابزار کدنویسی R-programming

دپارتمان سیستم بیولوژی

سیستم بیولوژی یکی از گرایشات اخیر بیوانفورماتیک است که به جهت تولید داده های حجیم مختلف و امکان ارتباط دهی آنها به هم و البته سیستمی بودن فرآیندهای زیستی در تمام ارگانیسم ها ایجاد و سپس مورد توجه محققین قرار گرفت. پژوهشگران درسال های اخیر با تدوین راه حل های نوینی به مطالعه زیست شناسی از نگاه سیستمی پرداختند که با کنار هم قرار دادن آنالیزهای مختلف بروی موضوع واحدی صورت گرفت.

جهت مطالعه بیشتر دوره های سیستم بیولوژی مرکز آموزش به لینک زیر مراجعه بفرمائید

کارگاه های آموزشی

آموزش دوره سیستم بیولوژی شبکه ای

بدست آوردن ژن های افتراقی

ترسیم شبکه برهمکنش پروتئین پروتئینی

آنالیز شبکه ترسیم شده

آنالیز ژن های هاب شبکه

آنالیز غنی سازی (فاکتورهای رونویسی، پروتئین کیناز و miRNA) شبکه و ادغام موارد بدست آمده به درون شبکه

آنالیز زیرشبکه های مهم تنظیمی (Gene regulatory network GRNs)

بررسی عملکردهای زیستی (BP) شبکه پروتئینی و زیرشبکه های استخراج شده تنظیمی

بررسی مسیرهای سیگنالینگ شبکه پروتئینی و زیرشبکه های استخراج شده تنظیمی

ارائه تحلیل اولیه نتایج بدست آمده به همراه پروتئین های مهم احتمالی درون شبکه

دپارتمان مهندسی پروتئین

مهندسی پروتئین شاخه از مطالعات بیوانفورماتیکی است که به بررسی حوزه ساختار پروتئینی معطوف می شود در این شاخه که یکی از پرکاربردترین اهداف آن در حوزه داروسازی است ارتباط تنگاتنگ این حوزه از بیوانفورماتیک با گرایش های بیوفیزیک و بیوشیمی رشته زیست شناسی است و علاقه مندان به این دو گرایش می توانند آینده خود را در تکنیک های مهندسی پروتئین متصور باشند.

به دو صورت مجموعه تکنیک های مهندسی پروتئین در یک دوره برای علاقمندان به یادگیری مجموعه تکنیک های مهندسی پروتئین و همچنین آموزش جداگانه هر تکنیک برای کسانی که علاقه مند به تکنیک خاصی هستند خدمات در این مرکز ارائه می شود.

کارگاه های آموزشی

  1. مدلسازی پروتئین با نرم افزار  Protein Modeling
  2. داکینگ مولکولی (پروتئین لیگاند یا پروتئین پروتئین) Molecular Docking
  3. شبیه سازی دینامیک مولکولی Molecular Dynamic Simulation