RNA-Seq یا توالی یابی ترانسکریپتومی یک تکنیک ابتکاری است که مطالعات transcriptome  را بر اساس تکنولوژی های نسل جدید توالی یابی (Next Generation Sequencing) انجام می دهد. RNA-Seq به طور گسترده وابسته به ابزارهای بیوانفورماتیکی توسعه یافته جهت پشتیبانی مراحل متفاوت پردازش داده ها است. تکنولوژی RNA-Seq می تواند در تشخیص صفات اپی ژنتیک کمک کننده باشد و از محدودیت هایی که در دو روش Microarray و PCR وجود دارد از قبیل وابستگی اولیه به اطالاعات در مورد ارگانیسمها، عاری است.

توالی یابی نمونه های آماده شده توسط دستگاه های توالی یاب حجم بالایی دارد وحجم چند گیگابایتی حاصل مراحل آزمایشگاهی توسط سوپر کامپیوترها و با ابزارهای بیوانفورماتیکی آنالیز می شود که نتایج آن به صورت ژن های افتراقی نمونه کنترل نسبت به تیمار گزارش می شود. این مرحله توسط مجموعه امیکس داده صورت می گیرد و نمونه ها می توانند به دو صورت آنلاین (از دیتابیس ها بین المللی) و به صورت داده های دستی به امیکس داده ارسال شود.